• Key: 4974579177
• DatasetKey: d55b6174-38c9-4c48-832a-ef08c278d127
• PublishingOrgKey: 81724943-d4d5-4b72-bfd6-3cfc5725c12a
• InstallationKey: 73ebc470-17bd-4130-a880-1be5cfb16e4d
• HostingOrganizationKey: f072f648-b8a4-47a0-9e1c-89d790645b5a
• PublishingCountry: CO
• Protocol: EML
• LastCrawled: 2025-03-28T03:11:30.158+00:00
• LastParsed: 2025-04-03T14:01:16.806+00:00
• CrawlId: 17
• ProjectId: 71475
• Extensions:
  • Http://rs.gbif.org/terms/1.0/DNADerivedData:
    • 0:
      • Http://rs.gbif.org/terms/pcr primer name forward: Bakt_341F
      • Https://w3id.org/mixs/0000050: MiSeq (Illumina)
      • Http://rs.tdwg.org/dwc/terms/occurrenceID: UTADEO:Redes:MAGPSC:OTU-1698
      • Https://w3id.org/mixs/0000044: 16s rRN
      • Https://w3id.org/mixs/0000014: water surface[ENVO_01001191]
      • Https://w3id.org/mixs/0000045: V3, V4
      • Http://rs.gbif.org/terms/pcr primer name reverse: Bakt_805R
      • Http://rs.gbif.org/terms/pcr primer reference: https://www.arb-silva.de/
      • Https://w3id.org/mixs/0000001: 6019 cubic meters
      • Http://rs.gbif.org/terms/pcr primer forward: CCTACGGGNGGCWGCAG
      • Https://w3id.org/mixs/0000087: Silva.nr v138
      • Http://rs.gbif.org/terms/pcr primer reverse: GACTACHVGGGTATCTAATCC
      • Https://w3id.org/mixs/0000058: MOTHUR v1.48.0
  • Http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/Permit:
    • 0:
      • Http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/permitText: ANLA:00213:2021:UTADEO
      • Http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/permitStatus: Permiso vigente
      • Http://data.ggbn.org/schemas/ggbn/terms/permitType: Permiso para la recolección de especímenes de especies silvestres
• BasisOfRecord: MATERIAL_SAMPLE
• OccurrenceStatus: PRESENT
• TaxonKey: 3222292
• KingdomKey: 3
• PhylumKey: 111
• ClassKey: 362
• OrderKey: 820
• FamilyKey: 5611
• GenusKey: 3222292
• AcceptedTaxonKey: 3222292
• ScientificName: Thermomonas Busse et al., 2002
• AcceptedScientificName: Thermomonas Busse et al., 2002
• Kingdom: Bacteria
• Phylum: Proteobacteria
• Order: Xanthomonadales
• Family: Xanthomonadaceae
• Genus: Thermomonas
• GenericName: Thermomonas
• TaxonRank: GENUS
• TaxonomicStatus: ACCEPTED
• DateIdentified: 2023-10-11T00:00:00
• DecimalLatitude: 11.072667
• DecimalLongitude: -73.684389
• CoordinateUncertaintyInMeters: 60000.0
• Elevation: 0.0
• ElevationAccuracy: 0.0
• Depth: 0.5
• DepthAccuracy: 0.5
• Continent: SOUTH_AMERICA
• StateProvince: Magdalena
• Gadm:
  • Level0:
    • Gid: COL
    • Name: Colombia
  • Level1:
    • Gid: COL.20_2
    • Name: Magdalena
  • Level2:
    • Gid: COL.20.26_2
    • Name: Santa Marta
• WaterBody: Mar Caribe
• HigherGeography: América|Sudamérica|Colombia|Región Caribe|Magdalena|Santa Marta
• GeoreferencedBy: Luis Garzón-Rodríguez
• Year: 2023
• Month: 4
• EventDate: 2023-04-17/2023-04-20
• StartDayOfYear: 107
• EndDayOfYear: 110
• Issues:
  • 0: COORDINATE_ROUNDED
  • 1: INSTITUTION_MATCH_NONE
• Modified: 2024-07-03T00:00:00.000+00:00
• LastInterpreted: 2025-04-03T14:01:16.806+00:00
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/legalcode
• OrganismQuantity: 3.0
• OrganismQuantityType: DNA sequence reads
• SampleSizeUnit: DNA sequence reads
• SampleSizeValue: 40439.0
• RelativeOrganismQuantity: 7.418581072726823e-05
• IsSequenced: True
• Identifiers:
  • 0:
    • Identifier: UTADEO:Redes:MAGPSC:OTU-1698
• Media:
• Facts:
• Relations:
• IsInCluster: False
• RecordedBy: Luis Garzón-Rodríguez
• IdentifiedBy: Katherine Bedoya-Urrego|Juan Fernando Alzate-Restrepo
• Preparations: Colecta definitiva: Preparación de muestra microbiológica|Extracción de ADN
• SamplingProtocol: Arrastre superficial
• DnaSequenceID:
  • 0: None
• GeodeticDatum: WGS84
• Class: Gammaproteobacteria
• CountryCode: CO
• RecordedByIDs:
  • 0:
    • Type: ORCID
    • Value: https://orcid.org/0000-0003-3660-9961
• IdentifiedByIDs:
  • 0:
    • Type: ORCID
    • Value: https://orcid.org/0000-0003-2578-4609
  • 1:
    • Type: ORCID
    • Value: https://orcid.org/0000-0001-7403-7373
• GbifRegion: LATIN_AMERICA
• Country: Colombia
• PublishedByGbifRegion: LATIN_AMERICA
• Habitat: Marino-costero superficial
• ScientificNameID: urn:lsid:marinespecies.org:taxname:571522
• InstitutionID: 860.006.848-6
• SamplingEffort: 36 arrastres
• County: Santa Marta
• EventRemarks: Época seca
• GbifID: 4974579177
• Language: es
• Type: PhysicalObject
• VerbatimIdentification: Thermomonas
• LocationRemarks: Muestras recolectadas en el departamento de Magdalena
• InstitutionCode: Fundación Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano (UTadeo)
• EventTime: 05:00:00/17:00:00
• NameAccordingToID: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=571522
• IdentificationRemarks: Extracción y secuenciación de las regiones V3-V4 del gen 16s rRNA con métodos metagenómicos empleando los primers Bakt_341F y Bakt_805R, clasificando las secuencias con la base de datos 16S Silva (Silva.nr v138) y revisado en GBIF.
• NameAccordingTo: WoRMS (2024). Thermomonas. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=571522 on 2024-08-20
• RecordNumber: MAGPSC
• Identifier: UTADEO:Redes:MAGPSC:OTU-1698
• VerbatimSRS: WGS84
• VerbatimCoordinateSystem: Grados, minutos, segundos
• GeoreferenceRemarks: Se eligió la coordenada de la estación más central dentro de un mustreo en el que se hizo un recorrido de 120 km. La incertidumbre se calculó como la mitad de la distancia recorrida.
• Locality: Muestreo durante 4 días en estaciones delimitadas por la isóbata de los 30 metros de profundidad ubicadas desde El Rodadero hasta el costado oeste del Golfo de Salamanca, incluyendo además puntos en el norte de la Ciénaga Grande de Santa Marta
• VerticalDatum: epsg:4326
• OccurrenceID: UTADEO:Redes:MAGPSC:OTU-1698
• VerbatimDepth: 0 a -1
• LocationID: http://marineregions.org/mrgid/25303
• OccurrenceRemarks: Recolectado a partir de muestras de microplástico
• HigherClassification: Bacteria | Proteobacteria | Gammaproteobacteria | Xanthomonadales | Xanthomonadaceae | Thermomonas